上海交通大学环境科学与工程学科历史可追溯到1928年设置的市政工程专业，曾培养出顾康乐、周文德、顾夏声、胡家骏、徐晓白等一批杰出校友。环境科学与工程学院成立于1999年9月，2001年和2002年获批环境工程博士点和专业学位硕士点，2003年获批环境科学与工程一级学科博士点，依托上海交大在工科、管理、医学等方面的学科基础，经过二十年快速发展，形成了在国内环境学科领域的特色优势，成为国际环境科学与工程领域具有一定影响的教学与科研机构。